鉴别验验对象：微生物型益生根瘤菌肥、乳酸酸奶、双歧杆菌酸奶、单一纯化微生物菌种
检测项目：微生物菌种纯化分离鉴别、菌群多样性分析；
1.食品双歧杆菌计数、双歧杆菌（两歧双歧杆菌鉴定）、双歧杆菌（婴儿双歧杆菌鉴定）、双歧杆菌（长双歧杆菌鉴定）、双歧杆菌（短双歧杆菌鉴定）、双歧杆菌（青春双歧杆菌鉴定）、双歧杆菌（动物双歧杆菌鉴定）
食品乳酸菌计数、乳酸菌（德氏乳杆菌保加利亚种鉴定）、乳酸菌（嗜酸乳杆菌鉴定）、乳酸菌（嗜热链球菌鉴定）、乳酸菌（罗伊氏乳杆菌鉴定）、乳酸菌（干酪乳杆菌干酪亚种鉴定）、乳酸菌（鼠李糖乳杆菌鉴定）、乳酸菌（植物乳杆菌鉴定）
2.微生物菌肥--有益微微生物：根瘤菌数、固氮菌数、磷细菌、硅酸盐细菌、放线菌、乳酸菌、酵母菌、芽孢杆菌数、枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、弗氏链霉菌、 秸秆腐熟菌、光合细菌等；
微生物菌肥--有害微生物（杂菌率）：霉菌杂菌数、粪大肠菌群、沙门氏菌等
3.饲料--有益微生物：乳酸菌、嗜酸乳杆菌、芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、双歧杆菌、粪肠球菌、酿酒酵母、光合细菌等
饲料--有害微生物：沙门氏菌、志贺氏菌、大肠菌群、粪大肠菌群、大肠杆菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽孢杆菌、单核细胞增生李斯特氏菌、铜绿假单胞菌等。
4.单一纯化微生鉴别（食用菌、其它微生物等）
5、污菌控制菌分析与方学法验证
小不点*微生物细菌鉴别
土壤、水体、粪便等样本中的微生物一般为混合菌，需要在一定条件下通过培养、分离、纯化后，得到纯菌。对纯的细菌、真菌等菌种，均可进行菌种鉴定服务。
菌种鉴定一般是提取纯菌A的基因组DNA，然后PCR扩增16s rDNA片段，之后通过一代测序或三代测序检测16S rDNA的全长，与国际上的数据库进行Blast比对，默认选取比对结果中相似性最高的前10位的物种分类信息，之后构建系统发育树，最后得出样本A与XX物种的相似性最高。
菌种鉴定菌种鉴定手段包括：
（1）常规鉴定
常规鉴定依据形态特征和理化特性表征，区分不同微生物间的差异，以微生物细胞的形态和习性表型为主要指标，通过比较微生物的菌落形态、理化特征和特征化学成分与典型微生物的差异进行鉴别，是经典的微生物分类鉴定法。其中，形态特征包括显微形态和培养特征；理化特性包括营养类型、碳氮源的利用能力、各种代谢反应、酶反应等；新种等可做细胞壁化学组分、肽聚糖种类，脂肪酸含量， DNA-DNA杂交、G+C摩尔百分比等。
在表型鉴定时应注意采用的培养基、培养时间和传代次数、培养环境对鉴定结果的影响。常见表征有：
1、培养物---菌落形态、颜色、形状、大小、色素、气味、PH等；
2、形态学---细胞形态、形状、大小、鞭毛类型、内容物、革兰氏染色、芽孢形态和抗酸、孢子形成模式及
形态；
3、生理学----耐酸碱特性PH范围、氧气耐受性、生长温度范围、耐盐性；
4、抑制性----胆盐耐受性、抗生素敏感性、染料耐受性；
5、血清学----凝集反应、荧光抗体；
6、化学分类----脂肪酸构成、微生物毒素、全细胞组成结构；
7、生态学----微生物来源与菌属间融合互斥性；
8、生化反应----碳源利用、碳水化合物的氧化、发酵条件及酶解模式；
（2）BioLog碳源自动分析鉴定
BioLog鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础，检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。该系统已获美国FDA认可，已逐步应用于食品和饮品企业、环保、海洋生物/水产品、制药、农业微生物、生物治理、化妆品、临床等领域的微生物鉴定试验中，可鉴定包括革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌、厌氧菌、酵母、丝状真菌在内的近2000种微生物。
（3）分子生物学鉴定（基因型鉴定）
应用分子生物学方法从遗传进化角度阐明微生物种群之间的分类学关系是目前微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。GIMCC拥有应用于微生物菌种分类鉴定的分子生物学实验室，配置有PCR仪、高速冷冻离心机、电泳仪、凝胶成像仪等先进设备，以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等系列序列分析软件。目前GIMCC可采用核酸序列分析法分析细菌16S rDNA/16S-23S rDNA区间序列、酵母18S rDNA和26S rDNA D1/D2序列及丝状真菌的18S rDNA和ITS1-5.8S-ITS2序列，构建系统进化树，提供科学的鉴定结果。
与表型特征不同，微生物基因型通常不受生长培养基或分离物活性的影响，只需分离到纯菌落便可用于分析。由于大部分微生物物种中核酸序列是高度保守的，所以基因型微生物鉴定方法理论上更值得信赖。基因鉴定法通常在无菌检查试验结果阳性、非无菌药品控制菌检查中疑似菌的鉴定、环境监控异常、偏差调查、培养基模拟灌装失败等微生物偏差调查中使用。
基因型微生物鉴定在医药产品的生产过程微生物污染控制中的作用越来越重要，为规范和指导医药生产和检验过程中的微生物鉴定工作，《中国药典》2020年版新增订3个基因型微生物鉴定相关通则：通则1021《细菌DNA特征序列鉴定法》、通则9108《DNA测序技术指导原则》、通则9109《标准核酸序列建立指导原则》。目前《伯杰氏系统细菌学手册》中对细菌分类的描述是通过遗传物质的分析比较来实现的。系统发育典型的分析方法通过比较细菌16S rRNA基因、真菌18S rRNA基因、ITS 区域碱基序列来实现，然后与经验证过的专用数据库或利用公共数据库进行比对。同一地点的同种菌，其表型特征和基因型特征是基本一致的。不同地点的同种菌，表型特征可能基本一致，但保守及可变区域的基因特征会有一定的差异性。因此，污染调查等应以基因型特征鉴定为主，表型特征鉴定为辅。
微生物细菌鉴别、病毒鉴别，对污染菌的控制与防范、对食品安全及生产指导、对特定菌的科学研究具有重要的科学指导意义，华检作为国内为数不多的一站式、一体化、综合科研服务提供商，建立了全面的细菌与病毒数据库，可以广大客户提供高质量的鉴定服务，欢迎来电咨询。
